第二日早朝，太监当庭宣布圣旨，令礼部左侍郎郑沂代表朝廷去西安祭奠秦王，并册立秦世子朱尚炳为新任秦王；另外令魏国公徐辉祖节制陕西驻军，太孙护军由瞿能任指挥使，耿璇为指挥佥事，随同魏国公巡视陕西。
早朝之后，朱允炆召见了礼部左侍郎郑沂、礼部尚书任亨泰、兵部尚书茹瑺、魏国公徐辉祖、开国公常升等人，商讨秦王的后事安排，礼部上报了其礼仪安排，朱允炆大致看了一下，感觉无比复杂，但看起来不像有问题的样子，问了几句，就让他们照此去办理了，令郑沂次日启程前往西安。任亨泰、郑沂领命而去。
朱允炆让茹瑺、徐辉祖、常升坐下，问道：“茹尚书、魏国公、开国公，孤最近在想一个问题，希望三位能够解孤之疑。”
“殿下请讲。”
“前些日子，东胜卫百户吴信侵吞屯卒赏赐，皇上震怒，将其正法后，遣使谕守边将士，点出边疆苦寒，供给困难，只能屯田自给，而士卒劳苦，出则御盗，居则望烽燧，令将士不要学吴信，否则国法从事。另外孤记得洪武三年，军户逃兵接近5万人，洪武二十六年，魏国公的统计，全国逃兵接近20万人，所以孤想问一下三位，军户到底出了什么问题？会有如此多的逃兵？东胜卫俯瞰河套，为抗御蒙古的最前沿，竟然出现了侵吞屯卒赏赐之事，这到底是什么原因？”
茹瑺微微一笑道：“殿下，臣记得卷宗里说当时吴信的妻子患了重病，无钱医治，所以动了侵吞屯卒赏赐的心思，被屯卒上告，因而被正法。相信这只是个案，况且侵吞数额不大，价值不过白银二十两。至于逃兵日多，臣以为是各卫所疏于管理，没有制定有效的策略，防止士兵逃脱，所以臣以为五军都督府需要加强整顿，否则大明的卫所崩坏，无力抵御蒙古，可能重演蒙古入主中原之祸。”
徐辉祖站起来道：“茹尚书的说法末将不能苟同，吴信一案虽然主犯死有余辜，但是边疆苦寒，东胜地处抗蒙前沿，土地贫瘠，产出极少，且缺医少药，吴信身为百户都无钱为妻子治病，普通士兵的窘境可想而知，故末将以为根本原因在于东胜卫条件太差，所以才会发生如此之事。至于卫所逃兵，这些士兵远离故土，半耕半农，负担太重，所以才会大量出现逃兵，五军都督府指定了严刑峻法，但还是无法遏制。”
茹瑺也站了起来，向乾清宫方向一拱手，道：“那魏国公大人是质疑皇上对吴信的处置吗？还是质疑皇上设立卫所的英明啊？”
徐辉祖大惊，跪在朱允炆面前道：“殿下明鉴，末将并无此意，吴信虽情有可原，但罪无可恕；至于卫所，末将以为只能严加控制才行。”
朱允炆不由得笑了，他发现文官真是杀人不用刀啊，一句话就把责任的根源都推到朱元璋那里了，别人还怎么和他愉快的聊天啊。所以他摆了摆手：“魏国公请起，孤认为任何事情都有两面性，有利也有弊，处置手段其实就是趋利避害而已，而且随着时间、条件的变化，利害可能会相互转化。所以历朝历代都从前朝吸收经验教训，但同时也会产生新的弊病。我们今天只是讨论事情，不要把事情涉及到皇上身上，也不要进行人身攻击，孤希望我们讨论问题的基础是事实和证据，希望能找到一个好的解决方案。”
茹瑺、徐辉祖、常升赶紧道：“谨遵殿下教诲。”
朱允炆想了一下道：“茹尚书，孤想要兵部整理几份资料，就是唐府兵的兴盛和衰落，以及其背后的原因是什么？孤希望有数据和例子作为佐证；还有宋朝募兵的优劣，也要详细分析。最后对于本朝卫所的情况，要摸一次底，能做到吗？”
茹瑺想了想道：“唐府兵、宋募兵这个都容易，不过卫所由五军都督府管理，情况摸底需要五军都督府出这份资料。”
朱允炆转向徐辉祖，道：“魏国公、开国公，如何？”
徐辉祖躬身道：“殿下，末将要节制陕西军兵，无法主持此事，这件事情还是交给开国公吧。”
“对了，孤疏忽了，开国公，你认为如何？”
常升道：“末将领命，不过还是希望殿下下明旨让前后左右中都督府各自负责所属的卫所，这样会快一些。”
“这个没问题，开国公认为需要多长时间？”
“至少半年。”
“可以，孤给你半年时间。”
事情定下来了，朱允炆就让茹瑺去忙了。然后让徐辉祖、常升下午到詹事院来，有事情要交代。
下午，詹事院。
朱允炆这次召集了徐辉祖、常升、瞿能、耿璇、郭钥、吴升、宋瑄、齐泰、王度等人，单独交代一下事情。等大家落座，朱允炆扫视了大家一眼，道：“这次派大家去陕西，任务很重，孤在这里分配以下大家的任务，请大家仔细倾听，切记保密。”
“殿下放心。”
“好的。”朱允炆到了墙边的舆图前，拿起竹竿道：“这次去陕西，魏国公要仔细甄选将领，在不影响战力的情况下，将卫指挥使对调，避免其拥兵自重。”
“末将领命。”
“再有就是孤的护卫军第一次出动，要委屈瞿能将军暂时任孤的指挥使了。”朱允炆笑着道。
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